办理儿童疫苗接种证明通常有以下几种方式：
线下办理
常规办理：儿童出生后，出生医院的产科接种室一般会为其接种卡介苗和首针乙肝疫苗，并发放预防接种证，上面记录了接种信息。若在医院未领取，家长需在孩子出生 1 个月内，携带户口本、出生医学证明、父母身份证等，到居住地的辖区预防接种门诊办理，工作人员会建立预防接种信息系统档案，并发放接种证。
补证及开具证明：如果预防接种证丢失，可携带儿童户口本或身份证到现居住地所在辖区的接种单位补办。对于需要开具预防接种查验证明的情况，如儿童入托、入学时，家长可携带儿童预防接种证，直接到儿童现居住地或就读学校所在辖区的接种单位开具。
线上办理
不同地区线上办理的方式和平台有所不同，以随申办（上海）和粤苗（广东）为例：
随申办（上海）：适用于 2018 年 6 月 1 日以后出生的本市儿童。家长登录 “随申办” APP 或小程序，实名登录后进入 “电子预防接种证” 模块，点击 “立即申请”，按提示操作即可申领。申领成功后，可在 “亮证” 处查看和下载电子预防接种证，也可使用 “凭证查询” 功能，进行入托入园入学预防接种凭证自助查验，生成的凭证可下载。
粤苗（广东）：下载 “粤苗” APP 或在微信打开 “粤苗” 小程序，登录并完成实名认证后，点击 “儿童接种”-“绑定儿童”，选择 “受接种者姓名和父母姓名绑定”，填写相关信息。绑定后，点击 “入学查验”-“查验报告” 或在 “电子预防接种证”-“入学” 模块查询，即可下载 “儿童入托、入学预防接种证查验报告”。
此外，部分地区可通过当地疾控中心微信公众号、政务 APP 等平台办理电子预防接种证或查验证明，具体可咨询当地预防接种单位或辖区疾控中心。