慈溪市转院证明的办理流程大致如下：
确定需要转院的患者首先在本市的三甲医院或三级专科定点医院进行治疗。
经治医师填写转诊申请表，说明转院理由。
所在科室科主任签字核准。
医院医保办登记备案。
医院分管院长签字同意。
市医保局驻人民医院协管医师开具转诊通知单。
患者持转诊通知单到指定的转诊地定点医院住院。
需要注意的是，重症病人转院时，病人家属及单位应解决好有关护送问题，必要时由经治科室派医护人员护送，并与被转医院有关人员做好交接手续。
另外，因每个地区医保管理中心/医保局规定不同，具体流程可能会有差异。在办理转院证明之前，建议先咨询慈溪当地的医保中心，了解详细的要求和注意事项，如本地哪几家医院有资格开转院证明、对医生是否有要求、回来报销需要准备哪些材料、是否可以家人代办报销手续以及转院证明的有效期等。
同时，准备好相关的病历资料及诊断证明等，以便顺利办理转院手续。转诊证明的有效期通常为3个月或者6个月，具体以当地规定为准。